Hầu hết các định dạng chương trình Masterchef đều bắt nguồn từ bản Masterchef của đài BBC Anh quốc. Masterchef Việt Nam có định dạng gần giống với định dạng của Masterchef Mỹ.

• Vòng thử thách: Ngay sau vòng loại, các thí sinh sẽ tham gia vòng thử thách để chọn ra những người cuối cùng tham gia MasterChef.
• Chiếc hộp bí mật: Ở những tập có số thí sinh lẻ (có cả tập 5 gồm 12 người), các thí sinh sẽ tham gia thử thách chiếc hộp bí mật. Mỗi thí sinh nhận một chiếc hộp giống nhau bên trong có nguyên liệu nấu ăn.
• Phần loại trừ: Diễn ra sau Chiếc hộp bí mật. Người chiến thắng ở phần trước thì thôi không phải tham gia phần này nữa. Người thua cuộc sẽ bị đuổi khỏi căn bếp MasterChef.
• Thử thách đồng đội: Ở những tập có số thí sinh chẵn (trừ trận chung kết còn 2 người) thì các thí sinh được chia ra làm hai đội. Đội trưởng hai đội là hai thí sinh nấu tốt ở phần trước đó. Đề bài thường là nấu một thực đơn phục vụ nhiều thực khách. Đội thắng sẽ do các thực khách bỏ phiếu. Đội thua sẽ phải vào Thử thách áp lực.
• Thử thách áp lực: Diễn ra sau Thử thách Đồng đội. Đội thua trong phần trước sẽ tham gia phần này. Có thể một số thí sinh sẽ được miễn phần này. Người thua cuộc sẽ bị đuổi khỏi căn bếp MasterChef.